子宫内膜增生症的主要病因是长期无孕激素拮抗的雌激素刺激而引起的，大多数患者发生在40岁以后。
内源性雌激素
(1)不排卵：育龄期妇女长期无排卵或稀发排卵、如多囊卵巢综合征、排卵障碍性异常子宫出血、分泌雌激素的卵巢肿瘤；缺少周期性分泌期的孕激素对抗转化，使子宫内膜长期处于雌激素作用的增生状态。
(2)肥胖：肥胖妇女的肾上腺分泌的雄烯二酮，经脂肪组织内芳香化酶作用而转化为雌酮；脂肪组织越多，转化能力越强，血浆中雌酮水平越高，因而造成持续性雌激素的影响也就越大。
(3)内分泌功能性肿瘤：内分泌功能性肿瘤是罕见的肿瘤，例如卵巢颗粒细胞瘤就是持续性分泌雌激素的肿瘤。
外源性雌激素
长期外源性雌激素摄入，如口服避孕药，绝经后雌激素补充治疗。
(1)雌激素替代疗法：围绝经期或绝经后，由于雌激素缺乏而有更年期综合征，同时还可能有骨质疏松、血脂代谢异常、心血管变化、甚至脑细胞活动的改变等。因而雌激素替代疗法逐渐被广泛应用，并已取得很好的效果。但是，单用雌激素，会刺激子宫内膜增生。单用雌激素一年，即可有20%妇女子宫内膜增生，而雌激素替代疗法的应用，常常是经年不断，甚至直到终生，长期如此，如若不同时联合应用孕激素，将有严重内膜增生，甚或子宫内膜癌的发生。
(2)他莫昔芬的应用：他莫昔芬被用于绝经后晚期乳腺癌患者，在雌激素低的条件下，又有微弱的类似雌激素的作用，故乳腺癌术后接受长期他莫昔芬治也可使子宫内膜增生。有报道称服用他莫昔芬超过48个月，约30.8%有内膜病变，其中包括内膜单纯性增生及复杂增生，并有个别内膜癌。因此，绝经后乳腺癌患者在服用他莫昔芬期间，应对此倍加注意。
其他
初潮过早；绝经晚；不孕；肿瘤家族史，尤其是子宫内膜癌、结直肠癌、卵巢癌和乳腺癌等。
