如何找出序列中短重复片段并标注 基因组中由寡核苷酸串联，重复排列的DNA序列，构成数量可变的串联重复序列，其中，微卫星DNA又称为短串联重复片列，是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列，具有种类多，分布广，高度多态性等特点，这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.短序列比对中，一般常用的算法主要有三个：（1）空位种子片段索引法，如MAQ、ELAND等，首先将读段切分，并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引，再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位，通过轮换种子考虑允许出现错配（mismatch）的各种可能的位置组合；（2）Burrows Wheeler转换法，如Bowtie、BWA、SOAP2等，通过B-W转换将基因组序列按一定规则压缩并建立索引，再通过查找和回溯来定位读段，在查找时可通过碱基替代来实现允许的错配；（3）Smith-Waterman动态规划算法，如BFAST，SHRiMP等，利用初始条件和迭代关系式计算两个序列的所有可能的比对分值，并将结果存放于一个矩阵中，利用动态规划的方法回溯寻找最优的比对结果。
新生儿丁酰基肉碱偏高？ 现在医院有必要筛选脚跟血液串联质谱，即检查各种有机酸和脂肪酸，氨基酸。串联质谱中通常会发现短链脂肪酸代谢异常，并且丁酰肉碱的浓度会增加。大多数原因是由于控制短链。
锚泊抗台的方法主要有（）。A、抛长短链八字锚 B、抛串联锚 C、以上均对 D、以上均 参考答案：A
